本品与含钙剂或含钙产品合并用药有可能导致致死性结局的不良事件。菏泽就发生数例此类悲剧（幼儿）。
   头孢曲松钠与含钙溶液，氨基苷类抗生素，氟康唑，拉贝洛尔，万古霉素，安吖定等有配伍禁忌。
   在我国，常见的含钙注射液有氯化钙注射液、葡萄糖酸钙注射液、复方氯化钠注射液(林格注射液)、乳酸钠林格注射液(哈特曼注射液)、复方乳酸钠葡萄糖注射液等。
   头孢曲松钠主由肾脏排泄（给药剂量的33%~67%，平均40%），其余部分经胆道系统排泄，故在胆汁与肾脏中浓度很高；在体内，因此药为阴离子，与钙离子亲和力较高而形成不溶性头孢曲松钙沉淀，并很快在胆管或胆囊以及肾收集系统形成结石(或泥沙)，尤其是在彼此均为高剂量或长疗程时更易发生。
   特别要说明的是在使用头孢曲松钠时，还要注意可能诱发免疫溶血性贫血（IHA），发生率为0.1％，其指征和症状包括严重溶血性贫血、血红蛋白尿、低血压、急性肾衰、发热以及背痛等。与其他头孢菌素类药物一样，头孢曲松钠可从血清白蛋白中置换出胆红素，从而发生胆红素脑病，故新生儿禁用，尤其是患有高胆红素血症的新生儿或可能发展为脑黄疸的新生儿和早产儿禁用。
   在配伍用药物时，应注意头孢曲松钠与其他头孢类抗生素一样，不能与碱性药物并用。一般情况下，当pH值＞8.5时，头孢类抗生素即可水解失效；当pH＜4.5时，即可发生沉淀失效。因此，临床应用头孢类抗生素的最佳方法是单独应用，必要时可间隔给药，绝不要为了图省事，怕麻烦，任意混合药物供注射，结果是很严重的。虽然实验表明配制好的注射液比较稳定，室温（25℃）可放置24小时，但临床仍主张即用即配，以确保安全。
   头孢曲松钠遇红霉素、血管活性药、苯妥英钠、氯丙嗪、异丙嗪、维生素Ｂ族、维生素Ｃ等也会出现浑浊，应分开使用，以免发生不良事件。
   两种方法可避免遇钙反应

　　头孢曲松钠与含钙溶液同时使用可发生不良事件并导致新生儿或婴儿死亡，如果都是静脉输入，可采取不同时间输入的方法，既不能同时加在一起使用，也不能先后连续静脉输入，需间隔给药，要在中间至少加一组其他液体相隔离，否则，会出现乳白色并带有絮状物。 　　另外，也可以采取同一时间不同途径注射的方法，即静脉注射头孢曲松钠和口服钙剂同时进行。 　　家长不用担心小儿口服钙片与头孢曲松钠会发生不良反应，因为口服钙片的吸收要经过胃肠道，胃肠黏膜都有保护作用。