我国村级卫生室建设主要存在以下几个方面的问题。一是村级卫生组织不健全，村级卫生室建筑达不到标准，基本诊疗器械匮乏。贫困地区和边远地区的村级卫生室基本达不到标准。以贵州省毕节地区为例，4158个村级卫生室，85.3%是“以家代室”、“居家坐医”，大部分村级卫生室业务区和生活区不分，诊断室、治疗室、药房混设，甚至农药、杀虫剂与医疗用药混放，埋下重大医疗安全隐患。

　　二是村级卫生室医疗卫生人员短缺、能力差、素质低，满足不了农民的医疗卫生服务的基本需求。目前全国平均每千农业人口只有村医1.1人。

　　三是村级卫生室的医疗行为缺乏有效监管，部分村级卫生室用药由村医自行购销，在小病诊治上存在过度医疗、滥用激素和抗生素等问题，使农村居民的安全用药存在较大隐患；村级卫生室可持续发展缺乏保障，后继乏人。